교육부가 서울시교육청의 자율형 사립고등학교 지정 취소 조치에 대해 18일 서울시교육청이 시정 명령을 따르지 않았으므로 '직권 취소' 결정을 내리기로 했다고 밝혔다.

교육부의 직권 취소 결정에 맞서 서울시교육청은 앞으로 15일 이내에 대법원에 소송을 제기할 수 있다. 다만 서울시교육청 측은 서울 지역 24개 자사고의 신입생 원서 접수 기간(19~21일)을 피해 오는 21일 이후에 법적 대응에 나설 방침이다.

서울시교육청 관계자는 "신입생 원서 접수 기간에는 불안감을 조성할 수 있어 행동을 자제하고, 이후 신중한 법률 검토를 거쳐 교육부 장관에 대한 기관 소송을 포함한 법적 대응에 나설 것"이라고 밝혔다. 앞으로도 자사고 지정 취소를 둘러싼 교육청과 교육부의 갈등이 계속 법적 공방으로 이어질 조짐이다.

이에 앞서 교육부는 서울시교육청의 자사고 지정 취소 조치에 대해 시정 명령을 내렸고, 서울시교육청은 지난 17일 시정 명령에 불응한다는 내용의 공문을 교육부에 발송했다.

서울시교육청은 공문을 통해 "(자사고 지정 취소는) 교육감의 권한을 적법한 절차에 따라 정당하게 행사한 것이므로 시정 명령의 대상이 될 수 없다"고 반박했다.

또 자사고 지정을 취소할 때 교육부 장관과 협의하도록 한 초중등교육법 시행령을 위반했다는 교육부의 지적에 대해서는 "협의를 통해 제시된 교육부 장관의 의견을 참고 자료로 고려할 수 있을 뿐, 그 의견을 반드시 따라야 하는 것은 아니다"라고 반박했다.

한편, 지정 취소된 6개 자사고는 교육청과 교육부의 갈등을 좀 더 지켜보겠다는 입장이다.

김용복 서울자사고교장협의회 회장(배재고 교장)은 "교육부의 대응과 진행 상황을 지켜본 후 구체적인 소송 절차에 들어갈 예정"이라고 밝힌 바 있다.